|
|
Detekce antimikrobiální rezistence u původců sexuálně přenosných infekcí
KREJČÍKOVÁ, Pavlína
Sexuálně přenosné infekce (STD) představují riziko pro veřejné zdraví, a to zejména z hlediska nárůstu antibiotické rezistence. V předkládané práci jsou shrnuty poznatky o nejčastějších původcích těchto infekcí, laboratorní diagnostice a současné epidemiologii, antimikrobiální rezistenci a jejích molekulárních mechanismech. Stanovení antimikrobiální citlivosti u většiny původců STD není v rutinní mikrobiologii možné z hlediska vysokých nebo specializovaných kultivačních nároků. Také, v současné době, z důvodu vyšší citlivosti detekce, jsou k diagnostice STD využívány metody molekulární biologie, které upozaďují provádění kultivace u Neisserie gonorrhoeae. Experimentální část projektu si kladla za cíl detekci popsaných mechanismů rezistence v pozitivních vzorcích na přítomnost původců STD vyšetřených pomocí mutiplexové PCR. V prvním kroku bylo použito celogenomové sekvenování (WGS). Bohužel, získané sekvence obsahovaly velké množství humánních sekvencí a extrahumánní sekvence tak neposkytovaly dostatečné pokrytí pro detekci jednotlivých genů a mutací. Nedostatečné pokrytí bylo zjištěno i po odstranění části humánní DNA ze vzorku pomocí saponinu a tritonu-X. Vzhledem k nevhodnosti WGS jsme optimalizovali a zavedli dříve popsané metody cílově specifické molekulární detekce nejčastějších mechanismů rezistence u N. gonorrhoeae. První metodou je PCR amplifikace s analýzou křivek tání (HRM). Jako referenční metodu k HRM jsme použili Sangerovo sekvenování šesti genů (penA, mtrR, ponA, porB, 23S rRNA, gyrA). V průběhu řešení práce byly optimalizovány teplotní profily pro PCR amplifikaci jednotlivých genů. Pro úplné pokrytí sekvenovaného úseku DNA (genu) dále bylo nutné navrhnout doplňující sekvenační primery. Pro klinické použití HRM pro detekci mechanismů rezistence u N. gonorrhoeae je nutné metodu ověřit na vzorcích DNA s identifikovanými mechanismy rezistence pomocí sekvenování jednotlivých fragmentů, které bylo v předložené práci optimalizováno.
|
|
|
Epidemiologická analýza sexuálně přenosných infekcí v Česku
Sekera, Jan Carlos
Sexuálně přenosné infekce patří k onemocněním, které vykazují nárůst a představují velký zdravotní problém především mezi mladou populací. Mají přímý dopad na sexuálně reprodukční zdraví prostřednictvím stigmatizace, neplodnosti, rakoviny a těhotenských komplikací a mohou zvýšit riziko HIV. Disertační práce se zaměřuje na epidemiologickou situaci sexuálně přenosných infekcí v Česku. Snaží se doplnit chybějící údaje o této skupině onemocnění a přispět tak analýzou k lepšímu pochopení vývoje a současného stavu v Česku. Práce je koncipována jako soubor článků. V rámci disertační práce autor úvodem představuje kontext svého odborného zaměření v rámci oblasti poznání, prostřednictvím publikovaných studií. Publikované studie, které tvoří tuto disertační práci, se zaměřovaly na čtyři významné oblasti problematiky sexuálně přenosných infekcí: zdravotní gramotnost, socio-demografickou analýzu injekčních uživatelů drog, testování na HIV v době pandemie a na regionální rozdíly. První ze souboru zařazených prací analyzovala úroveň zdravotní gramotnosti v oblasti problematiky HIV/AIDS. Poznatky o nerovnostech ve zdravotní gramotnosti jsou zásadním předpokladem pro aplikaci preventivních opatření. Druhá ze zařazených studií se zaměřovala na analýzu sexuálně přenosných infekcí v populaci injekčních uživatelů...
|
|
|
Epidemiologická analýza sexuálně přenosných infekcí v Česku
Sekera, Jan Carlos ; Dzúrová, Dagmar (vedoucí práce) ; Pikhart, Hynek (oponent) ; Rob, Filip (oponent)
Sexuálně přenosné infekce patří k onemocněním, které vykazují nárůst a představují velký zdravotní problém především mezi mladou populací. Mají přímý dopad na sexuálně reprodukční zdraví prostřednictvím stigmatizace, neplodnosti, rakoviny a těhotenských komplikací a mohou zvýšit riziko HIV. Disertační práce se zaměřuje na epidemiologickou situaci sexuálně přenosných infekcí v Česku. Snaží se doplnit chybějící údaje o této skupině onemocnění a přispět tak analýzou k lepšímu pochopení vývoje a současného stavu v Česku. Práce je koncipována jako soubor článků. V rámci disertační práce autor úvodem představuje kontext svého odborného zaměření v rámci oblasti poznání, prostřednictvím publikovaných studií. Publikované studie, které tvoří tuto disertační práci, se zaměřovaly na čtyři významné oblasti problematiky sexuálně přenosných infekcí: zdravotní gramotnost, socio-demografickou analýzu injekčních uživatelů drog, testování na HIV v době pandemie a na regionální rozdíly. První ze souboru zařazených prací analyzovala úroveň zdravotní gramotnosti v oblasti problematiky HIV/AIDS. Poznatky o nerovnostech ve zdravotní gramotnosti jsou zásadním předpokladem pro aplikaci preventivních opatření. Druhá ze zařazených studií se zaměřovala na analýzu sexuálně přenosných infekcí v populaci injekčních uživatelů...
|
|
|
Sexuálně přenosné infekce v Praze: Sociálně epidemiologická analýza
Sekera, Jan Carlos ; Dzúrová, Dagmar (vedoucí práce) ; Jágrová, Zdeňka (oponent)
Sexuálně přenosné infekce se ve světovém měřítku vyskytují v obrovském rozsahu a každým rokem zasahují do života stamilionů osob. Současná věda a medicína umí proti většině těchto infekcí bojovat, přesto se tyto infekce stále nedaří eradikovat a namísto toho se v mnohých částech světa šíří rychleji než kdy před tím. Předkládaná diplomová práce se zaměřuje na situaci sexuálně přenosných infekcí v Praze, a zevrubně i v České republice a snaží se analyzovat tuto situaci z pohledu sociální epidemiologie. Práce se snaží identifikovat nejrizikovější skupiny osob a snaží se odhalit vztah mezi rizikovým faktorem a expozicí vůči dané infekci. K analýze situace sexuálně přenosných infekcí v Praze bylo použito klasických epidemiologických ukazatelů prevalence a incidence, přičemž vztah mezi jednotlivými proměnnými byl zkoumán zejména metodou AnswerTree v rámci statistického programu SPSS. Vývoj sexuálně přenosných infekcí byl poté analyzován pomocí bazického a řetězového indexu. V předkládané práci bylo zjištěno, že sexuální rizika jsou nejvíce determinována sexuálním chováním a dále regionem, z něhož daný jedinec pochází. Mužská část populace byla identifikována jako rizikovější nežli ženská. Dále bylo zjištěno, že nejvíce reportovaných případů sexuálně přenosných infekcí v Praze připadá na infekci kapavky,...
|
host ::
RSS.